是次作品是《超智能足球》系列的電影序章,是電視版第二季故事的後續。主要講述高迅和「超智能足球員」潛龍合力阻止史坦尼博士利用超智能足球技術征服世界的陰謀。為此,潛龍不得不執行終止程式,最終導致自我毀滅。某日系統重啟,潛龍重生歸來,面對昔日的好友,卻全無印象。而陰謀似乎也仍在進行中……